Виступи в Росії
Емін Махмудов народився 27 квітня 1992 року в Азербайджані. Проте вже в п'ятнадцятирічному віці він вступив до футбольної академії російського «Сатурна». У 2010 році по досягненні повноліття Махмудов підписав професійний контракт з клубом і почав свої виступи на високому рівні. У дебютному сезоні він зіграв 22 матчі за клуб, забивши свій перший гол.Взимку 2011 року він підписав контракт з московський «Спартаком». Однак не зміг там закріпитися в основі – за першу половину сезону він провів 16 матчів, після чого був відправлений в оренду в «Томь». Там він зіграв ще вісім матчів, а повернувшись в «Спартак», зумів вийти на поле лише один раз за цілих півроку. У підсумку було прийнято рішення відправити його в оренду в «Крилья Совєтов», де Емін Махмудов почав поступово звикати до нової обстановки. У результаті В січні 2014 року його контракт був викуплений самарським клубом за 250 тисяч євро. До літа 2015-го Емін так і не зміг пробитися в стартовий склад. Він зіграв усього лише 20 матчів. Керівництво клубу дало йому останній шанс, відправивши в оренду в «Мордовію», де футболіст відіграв 18 матчів за сезон. Його виступи не вразили «Крила Рад». Тому контракт з ним продовжений не був. Проте півзахисник зацікавив португальський клуб «Боавішта», який і запропонував йому співпрацю протягом двох років.