Львів
C
» » Денверская класифікація хромосом як основа кариотипирования

Денверская класифікація хромосом як основа кариотипирования

Всі живі організми містять в ядрах клітин певний набір генетичного матеріалу. У эукариотических клітинах він представлений хромосомами. Для зручності обліку та наукових розвідок каріотип систематизують за допомогою різних методик. Познайомимося з прийомами впорядкування генетичного матеріалу на прикладі людських хромосом.

Класифікація хромосом людини

Каріотип – хромосомний набір (диплоїдний), що знаходиться в будь-із соматичних клітин організму. Він є характерним для даного організму і однаковий у всіх клітинах, за винятком статевих.


Хромосоми в каріотипі бувають:
  • аутосоми, не відрізняються у особин різної статі;
  • статеві (гетерохромосоми), відрізняються за будовою у особин різної статі.
  • Клітини людського організму містять 46 ниток ДНК, з них 22 пари аутосом і одна - статевих. Це диплоїдний 2n набір генетичного матеріалу. Пара гетерохромосом у жінок позначається XX, а в чоловіків – XY, позначення каріотипу, відповідно, 44+XX та 44+XY. У статевих клітинах (гаметах) є гаплоїдний або одинарний 1n набір ДНК. Яйцеклітини містять 22 аутосоми і одну X-хромосому, сперматозоїди - 22 аутосоми і одну з гетерохромосом, X або Y.

    Навіщо потрібна ідентифікація та класифікація хромосом

    Денверская і Паризька системи класифікації спадкового матеріалу, що широко використовуються в науковому співтоваристві, покликані уніфікувати і узагальнити уявлення про каріотипі. Загальний підхід потрібен для правильного представлення та інтерпретації результатів досліджень в області генетики, каріосистематики, селекції.


    Денверская класифікація хромосом як основа кариотипирования
    Схематично каріотип зображують за допомогою ідеограми – послідовності систематизованих і розташованих за спаданням розміру хромосом. Ідеограма відображає не тільки розміри спирализованних ДНК, але і деякі морфологічні характеристики, а також особливості їх первинної структури (області гетеро - і эухроматина). За допомогою аналізу цих графіків встановлюють ступінь спорідненості між різними систематичними групами організмів. У каріотипі можуть перебувати пари аутосом, практично однакові за розміром, що ускладнює їх правильне розташування і нумерацію. Розглянемо параметри, які враховують Денверская і Паризька класифікація хромосом людини.

    Результати конференції в Денвері, 1960 рік

    В зазначеному році в місті Денвері, США, відбулася конференція з хромосомами людини. На ній різні підходи до систематизування хромосом (за розміром, положенням центромер, ділянок з різним ступенем спіралізаціі і т. д.) були об'єднані в єдину систему. Рішенням конференції стала так звана Денверская класифікація хромосом людини. Дана система керується принципами:
  • Всі аутосоми людини пронумеровані по порядку від 1 до 22 по мірі зменшення їх довжини, статевим хроматидам присвоєно позначення X і Y.
  • Хромосоми каріотипу розбиті на 7 груп з урахуванням положення центромер, наявності супутників і вторинних перетяжок на хроматидах.
  • Для спрощення класифікації використовується центромерний індекс, який розраховується діленням довжини короткого плеча на всю довжину хромосом і виражається у відсотках.
  • Денверская класифікація хромосом як основа кариотипирования

    Денверская класифікація хромосом є загальновизнаною у світовому науковому співтоваристві.

    Групи хромосом та їх характеристика

    Денверская класифікація хромосом включає сім груп, в яких аутосоми розташовані за порядком нумерації, але розподілені нерівномірно по кількості. Це пов'язане з ознаками, за якими вони розподіляються в групи. Докладніше про це в таблиці.

    Група хромосом



    Номери пар хромосом



    Особливості будови хромосом в групі



    A



    1-3



    Довгі хромосоми, відрізняються один від одного. У 1 і 3 парах положення перетяжки метацентрическое, по 2 пари - субметацентрическое.



    B



    4 і 5



    Хромосоми коротше попередньої групи, первинна перетяжка розташована субметацентрически (близько до центру).



    C



    6-12 X-хромосома



    Хромосоми середнього розміру, всі неравноплечие субметацентрические, складно идивиндуализируемие. Ідентична за розміром і формою аутосомам групи, реплікацію закінчує пізніше інших.



    D



    13-15



    Хромосоми в групі середніх розмірів з практично крайовим положенням первинної перетяжки (акроцентрические), мають супутники.



    E



    16-18



    Короткі хромосоми, 16 парі равноплечие метацентрические, 17 і 18 - субметацентрические.



    F



    19 і 20



    Короткі метацентрики, практично не відрізняються один від одного.



    G



    21 та 22 Y-хромосома



    Короткі хромосоми з супутниками, акроцентрические. Мають незначні відмінності будови і розмірів. Трохи довше інших хромосом групи, на довгому плечі є вторинна перетяжка.

    Як бачимо, Денверская класифікація хромосом базується на аналізі морфології без будь-яких маніпуляцій з ДНК.

    Паризька класифікація хромосом людини

    В основі даної класифікації, введеної з 1971 року, лежать методи диференційованого фарбування хроматину. В результаті рутинної забарвлення всі хроматиди набувають власний малюнок зі світлих і темних смуг, завдяки чому легко ідентифікуються всередині груп.
    Денверская класифікація хромосом як основа кариотипирования
    При обробці хромосом різними барвниками виявляються окремі сегменти:
  • Q-сегменти хромосом флуоресціюють в результаті застосування барвника акрихін-іприту.
  • G-сегменти виявляються після фарбування за методом Гімза (збігаються з Q-сегментами).
  • Фарбування R-сегментів передує контрольована термічна денатурація.
  • Для зазначення розташувань генів на хромосомах вводяться додаткові позначення:
  • Довге плече хромосоми позначається малою літерою q, короткий – рядкової p.
  • Всередині плеча виділяють до 4 районів, які нумерують від центромери до теломерному кінця.
  • Нумерація смуг всередині районів також йде в напрямку від центромери.
  • Якщо положення гена в хромосомі відомо точно, його координатою є індекс смуги. Коли ж локалізація гена менш визначена, його позначають знаходяться в довгому або короткому плечі.
    Денверская класифікація хромосом як основа кариотипирования
    Для точного картування хромосом, вивчення мутагенезу та гібридизації якою-небудь однією методикою не обійтися. Денверская класифікація хромосом і Паризька в даному випадку нерозривно пов'язані і доповнюють один одного.